É o ano de 1948. Chegam Agostinianos a São Paulo para implantação de mais uma Comunidade. Em 4 de maio de 1950 tomam posse de uma Paróquia no Bairro de Belém.

Iniciava-se, assim, uma nova etapa dos Agostinianos no Brasil.

Os Padres Agostinianos, que desde a origem da Ordem de Santo Agostinho dedicam-se fundamentalmente ao ministério Pastoral, ao magistério e às obras sociais, sentiram que era chegado o momento de iniciar demandas para a instalação de uma nova escola.

No triênio 1954-57, o Padre Honório Gutiérrez, na época Superior Provincial, iniciou entendimentos com a firma "Moinho Santista", visando à aquisição de um imóvel, dentro dos limites da paróquia, para nele instalar um estabelecimento de ensino.

Tais entendimentos só foram bem sucedidos em 1958, quando era Superior Provincial o Padre Matias Boñar.

No dia 24 de fevereiro de 1959, foram assinadas as escrituras de compra do imóvel situado à Rua Marques de Abrantes, no 365.

Em março de 1960, com algumas salas já prontas, instalou-se o curso do antigo Ensino Primário.

Continuaram as obras em ritmo acelerado, e no dia 1o de maio de 1963, festa de São José, era inaugurado o Colégio Agostiniano São José (Unidade I) e em 06 de fevereiro de 1997 inaugurou-se o Colégio Agostiniano São José (Unidade II).